泰昌皇帝说到这里突然止住了嘴，半晌后又摇头长叹道：“久闻东林书院大门书有对联一副：-风声、雨声、读书声，声声入耳；家事、国事、天下事，事事忧人-……现在国事艰辛如此，这一众大臣怎么一天到晚就惦着在后宫搅事？郑贵妃说到底还是朕的庶母，皇三弟和朕争位一事说到底也是朕的家事，时过境迁，朕都不放在心上了，他们怎么反倒容不下呢？“
万历四十八年八月二十九日，泰昌皇帝自知行将不起，就急召孙承宗觐见。孙承宗是东林党宗师叶向高的弟子，而叶向高则是詹事府正詹事，也就是泰昌皇帝的开蒙恩师。泰昌皇帝对东林党青眼有加，很大程度上也是受了叶向高的影响。
泰昌皇帝对叶向高一向很尊敬，张口必称“先生“，如果泰昌皇帝不是贵为天子的话，那孙承宗甚至可以叫他一声“师兄“。多年来孙承宗一直深受泰昌皇帝信任，泰昌皇帝不给孙承宗实职，而是任命他为詹事府经筵讲官，这个职务不但是太子的贴身参谋，也是皇太孙的老师。从很早以前开始，泰昌皇帝就有意要把孙承宗培养成自己儿子的重臣，现在他觉得托孤的时候已经到了。
“恺阳（孙承宗的号）老成稳重，有卿辅佐太子，朕无忧矣。“
听到这明显是托付后事的话，孙承宗没有再说什么场面话，而是郑重其事地向泰昌皇帝保证道：“臣虽愚钝，但愿效武侯之志，鞠躬尽瘁、死而后已。“
泰昌皇帝命人喊出太子，并让太子送孙承宗出殿。太子本来就对自己的老师很尊重，现在听到父皇的命令后，就效法民间弟子之礼，带孙承宗到外殿等候。孙承宗走后，泰昌皇帝就垂询起自己的陵墓来，它当然远远还没有完成。泰昌皇帝当机立断，下令等自己死后就把遗体安葬在景泰皇帝为自己造的坟墓里，那座坟墓在英宗复辟后一直空着，泰昌皇帝觉得那坟墓的规模和地点都不错。
后事已经交代好了，儿子也托付给最信任的孙承宗了，现在就连陵墓也有了着落，泰昌皇帝就打算为自己的生命作最后一次努力：“有鸿胪寺官进药，何在？“
泰昌皇帝病危后，鸿胪寺丞李可灼就炼制了几枚大还丹。所谓“大还丹“就是氧化汞，加热水银矿石时，红色的水银矿石会首先被还原成银色的金属汞，金属汞在继续受热后又会通过氧化反应变成红色的氧化汞。当时的人们不清楚这里面的变化，见到这个从红变白、然后又从白变红的过程就觉得很神奇，因此将氧化汞称为“大还丹“。
从秦始皇开始，人们就认为，这种“大还丹“既然能从红变白、再从白回到红，那么它里面就隐藏着返老还童的秘密，能把老人“还“成少年，是能起死回生、活死人而肉白骨的“仙丹妙药“。
泰昌皇帝安排好后事后，就吩咐鸿胪寺进药，准备靠这种仙丹来救自己一命。
内阁都不愿意承担风险，最后首辅方从哲就命令两个太监为皇帝试药，其中一人当即死亡而另一人幸免。经过泰昌皇帝的仔细观察，幸免的太监似乎红光满面，于是就坚持要求吃药。二十九日午时，泰昌皇帝吃下第一枚药丸，入夜前出现了些许饥饿感，泰昌皇帝大喜，连声高呼李可灼为“忠臣“，并随即服下第二枚氧化汞药丸。
数小时后，万历四十八年九月一日五更，泰昌皇帝崩。
次日，乾清宫中旨下，李选侍要求群臣遵照先帝遗诏，拥立皇太子朱由校承续大统；下中旨令礼部议先帝尊号、明岁年号。
“天下岂可托妇人？“中旨传出后，杨涟双目尽赤，他宣称李选侍是要仿效万历朝的先例。
万历继位时因为年龄小，在二十岁亲政前，由皇太后垂帘听政。
杨涟宣布李选侍想垂帘听政，然后又大叫起来：“有逆臣弑君！这必定是李选侍和郑贵妃串通弑君。“
“不错，正是如此。李选侍企图封皇后，而郑贵妃企图封皇太后，故而狼狈为奸，互为依仗。“左光斗认为杨涟的想法很有道理，他立刻给这次进药事件下了定论，“先帝英明神武，洞悉其奸，结果她们就串通一气，指示贼臣李可灼献红丸弑君。“
高攀龙也义愤填膺地附和道：“如果让李选侍垂帘听政的话，后宫恐有武后之乱，我大明社稷危矣！“
“不错，而且恐有秽乱后宫之事……“杨涟深谋远虑地推理分析起来。他认为李选侍年纪太轻，而皇太子已经快十六岁了，如果把李选侍留在新帝身边，恐怕会出现类似武则天嫁给唐高宗那种事情，由儿子笑纳老子的妃子。虽然杨涟说得很隐晦，但他还是明白无误地把这层意思表达出来了：“为了大明的江山社稷，一定得把李选侍驱逐出后宫。“
“你们知道自己在说什么吗？“方从哲听到这些言论后大惊失色。谋逆这种词，东林党说过无数多次，人人早就听习惯了，但这次他们提出的理由事关皇室尊严，方从哲作为内阁首辅，觉得自己有必要制止这种给皇室抹黑的行为。
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